Terminatör adındaki ilk makinenin Sarah Connor'ı ve henüz doğmamış oğlu John'u öldürme girişiminin üzerinden on yılı aşkın bir süre geçmiştir. Makinelere karşı yürütülecek insan direnişinin gelecekteki lideri olacak olan John, artık sağlıklı bir çocuktur. Ancak kendi bilincine varan bilgisayar sistemi Skynet, T-1000 adında başka bir Terminatör'ü zamanda geriye gönderir. Selefinden çok daha gelişmiş ve güçlü olan bu yeni Terminatör'ün tek görevi, John Connor'ı henüz çocuk yaştayken yok etmektir. Neyse ki Sarah ve John, T-1000 tehdidiyle tek başlarına mücadele etmek zorunda kalmaz; 1984'te Sarah Connor'ı öldürmeyi başaramayan modelle birebir aynı olan başka bir Terminatör de onları korumak üzere geçmişe yollanır. John bu Terminatör'e insanlığı öğretirken, Sarah ise Skynet'in ve Makinelerin ortaya çıkışını engellemeye çalışır.